企业会代扣代缴个人所得税，但纳税人在税法规定的纳税期限内，由纳税人自行向税务机关申报取得的应税所得项目和数额，按照事实填写个人所得税纳税申报表，也是可以纳税申报。但需要年所得达到12万元的纳税人，平时有应扣未扣税款，税务机关只补征其应扣未扣的税款，不加收滞纳金，也不会罚款。个税缴纳的详细规定请看自行纳税申报是否需要补缴税款征收滞纳金文章。
依据我国《税收征管法》和《国家税务总局关于进一步做好年所得12万元以上个人所得税自行纳税申报工作的通知》规定，年所得达到12万元的纳税人，平时有应扣未扣税款的，在办理年度自行纳税申报时只要如实申报收入情况，税务机关只补征其应扣未扣的税款，不加收滞纳金，也不得罚款，更不应作为偷税处理。
自行申报纳税，是指在税法规定的纳税期限内，由纳税人自行向税务机关申报取得的应税所得项目和数额，如实填写个人所得税纳税申报表，并按税法规定计算应纳税额的一种纳税方法。
纳税义务人有下列情形之一的，应当按照规定到主管税务机关办理纳税申报:
下列人员为自行申报纳税的纳税义务人:年所得在12万元以上的，从中国境内两处或两处以上取得工资，薪金所得的，从中国境外取得所得的，取得应税所得，没有扣缴义务人的等。
年所得额在12万元以上的纳税人，在纳税年度终了后3个月内到主管税务机关办理纳税申报。
一般情况下，纳税人应在取得应税所得的次月15日内向主管税务机关申报所得并缴纳税款。扣缴义务人每月扣缴的税款，应当在次月15日内缴入国库，并向主管税务机关报送相关资料。
如果，纳税人未按照规定的期限办理纳税申报和报送纳税资料的，由税务机关责令限期改正，可以处以2000元以下的罚款;情节严重的，可以处以2000元以上10000元以下的罚款。
年所得额在12万元以上的纳税人，需要在纳税年度终了后的3个月内到主管税务机关办理纳税申报。正常情况下，纳税人应在取得应税所得的次月15日内向主管税务机关申报所得并缴纳税款，还向税务机关报送相关资料。关于个税的税率可以点击自行纳税申报是否需要补缴税款征收滞纳金中的卡片领取资料包!
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