在政府会计制度下，“经营结余”“经营结存” 是不同性质的会计科目，年末结转处理有所不同：
- 经营结余的年末结转：“经营结余” 科目核算事业单位在专业业务活动及其辅助活动之外开展非独立核算经营活动取得的收支相抵后的余额 。年末结账后，应当对 “经营结余” 科目进行结转。
- 如果 “经营结余” 科目为贷方余额，说明经营活动有盈利，将余额转入 “非财政拨款结余分配” 科目，会计分录为：
借：经营结余
贷：非财政拨款结余分配
- 如果 “经营结余” 科目为借方余额，说明经营活动发生亏损，为保持 “经营结余” 科目年末无余额，此时不进行结转，亏损留在 “经营结余” 科目中，待以后年度经营盈利弥补。
- “经营结存” 的理解与年末处理：需要说明的是，政府会计制度中没有 “经营结存” 这个会计科目，你可能说的是 “经营结余”，或者是 “资金结存” 科目中与经营活动相关的部分（“资金结存” 科目核算单位纳入部门预算管理的资金的流入、流出、调整和滚存等情况）。
- “资金结存” 科目年末会根据预算收支类科目结转后的余额进行调整，如将 “经营预算收入” 和 “经营支出” 等预算类科目结转至 “经营结余”（预算会计）后，“经营结余”（预算会计）再结转至 “非财政拨款结余 —— 累计结余”，同时相应调整 “资金结存” 的金额。一般来说，“资金结存” 年末有余额，反映单位预算资金的累计滚存情况，不需要再结转到其他科目。
在实际操作中，要严格按照政府会计制度的规定进行会计核算和年末结转，确保会计信息的准确性和合规性。
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